{"id":26984,"date":"2022-04-26T08:29:16","date_gmt":"2022-04-26T14:29:16","guid":{"rendered":"https:\/\/otech.uaeh.edu.mx\/noti\/?p=26984"},"modified":"2022-04-26T08:29:16","modified_gmt":"2022-04-26T14:29:16","slug":"el-estudio-genetico-mas-grande-hasta-la-fecha-revela-perfiles-de-adn-que-conducen-al-cancer","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/otech.uaeh.edu.mx\/noti\/ciencia\/el-estudio-genetico-mas-grande-hasta-la-fecha-revela-perfiles-de-adn-que-conducen-al-cancer\/","title":{"rendered":"El estudio gen\u00e9tico m\u00e1s grande hasta la fecha revela perfiles de ADN que conducen al c\u00e1ncer"},"content":{"rendered":"<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">Los c\u00e1nceres son como copos de nieve maliciosos.\u00a0Cada uno alberga un conjunto \u00fanico de mutaciones en sus genes, volvi\u00e9ndolos gradualmente hacia el lado oscuro.\u00a0Eventualmente, sin tener en cuenta a sus vecinos, las c\u00e9lulas mutadas destruyen tejidos, \u00f3rganos y vida.<!--more--><\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">Pero su conjunto de mutaciones gen\u00e9ticas, una firma, tambi\u00e9n puede ser su ruina.\u00a0Al igual que las huellas dactilares o el ADN dejado en la escena del crimen, podemos usar esas firmas para cazar c\u00e9lulas cancerosas, atrapando a los culpables con medicamentos y dejando en paz a las c\u00e9lulas sanas e inocentes.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">La clave es una base de datos que documente estas firmas.\u00a0Las huellas dactilares son in\u00fatiles si no hay nada con lo que compararlas.\u00a0La investigaci\u00f3n del \u00e1rbol geneal\u00f3gico no ser\u00eda posible sin los sitios de genealog\u00eda de c\u00f3digo abierto.\u00a0Del mismo modo, para perseguir a terroristas biol\u00f3gicos como el c\u00e1ncer, necesitamos un libro completo de culpables de mutaciones gen\u00e9ticas como referencia.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">Lo acabamos de conseguir.\u00a0<a style=\"color: #000000;\" href=\"https:\/\/www.science.org\/doi\/pdf\/10.1126\/science.abl9283\">En un estudio masivo que<\/a>\u00a0cubri\u00f3 m\u00e1s de 12,000 tumores, un equipo del Reino Unido traz\u00f3 un mapa de los cambios gen\u00e9ticos que hacen que las c\u00e9lulas normales se conviertan en cancerosas.\u00a0Un tesoro oculto, el conjunto de datos captur\u00f3 &#8220;huellas dactilares&#8221; gen\u00e9ticas \u00fanicas de tipos comunes de c\u00e1ncer, pero tambi\u00e9n mutaciones individuales raras que reflejan la historia de una persona.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">El estudio y su cat\u00e1logo resultante es el m\u00e1s grande de su tipo.\u00a0Al comparar el nuevo atlas de mutaciones con estudios previos, el equipo encontr\u00f3 58 nuevos, lo que les dio pistas sobre posibles cambios gen\u00e9ticos y factores de estilo de vida que impulsan el c\u00e1ncer.\u00a0Luego desarrollaron un algoritmo para hacer coincidir las firmas mutacionales en la base de datos con nuevas muestras de tejido, construyendo un sistema completo de investigaci\u00f3n de la escena del crimen para la detecci\u00f3n del c\u00e1ncer.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">&#8220;La raz\u00f3n por la que es importante identificar las firmas mutacionales es porque son como huellas dactilares en la escena del crimen: ayudan a identificar a los culpables del c\u00e1ncer&#8221;,\u00a0<a style=\"color: #000000;\" href=\"https:\/\/www.genengnews.com\/topics\/omics\/largest-study-of-cancer-wgs-data-uncovers-dozens-of-new-mutational-signatures\/\">dijo<\/a>\u00a0la autora principal del estudio, la Dra. Serena Nik-Zainal de la Universidad de Cambridge.\u00a0&#8220;Algunas firmas mutacionales tienen implicaciones cl\u00ednicas o de tratamiento: pueden resaltar anomal\u00edas que pueden ser atacadas con medicamentos espec\u00edficos o pueden indicar un posible &#8216;tal\u00f3n de Aquiles&#8217; en c\u00e1nceres individuales&#8221;.<\/span><\/p>\n<h3 style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">El giro<\/span><\/h3>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">Tenemos aproximadamente 30 mil millones de c\u00e9lulas en nuestros cuerpos.\u00a0Con la edad, el genoma de cada c\u00e9lula cambia lentamente sus letras de ADN.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">\u201cEn este momento, cada c\u00e9lula de mi cuerpo est\u00e1 acumulando mutaciones, por lo que si viven lo suficiente, ser\u00e1 inevitable que terminen desarrollando un tumor\u201d,\u00a0<a style=\"color: #000000;\" href=\"https:\/\/elpais.com\/ciencia\/2022-04-22\/serena-nik-zainal-nunca-llegaremos-a-vivir-sin-cancer-pero-si-retrasaremos-su-aparicion.html\">dijo<\/a>\u00a0Nik-Zainal.\u00a0\u201cDicho esto, recordemos que un humano est\u00e1 hecho de 30 mil millones de c\u00e9lulas, todas acumulando mutaciones, y solo una de ellas me va a provocar un c\u00e1ncer a lo largo de mi vida.\u00a0Esto es incre\u00edble.&#8221;<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">Entonces, \u00bfpor qu\u00e9 algunas c\u00e9lulas normales se estropean?<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">Sabemos desde hace d\u00e9cadas que las ediciones de copia del ADN pueden activar genes oncog\u00e9nicos o pro-c\u00e1ncer, al tiempo que desactivan genes que normalmente protegen contra este proceso.\u00a0Las c\u00e9lulas cancerosas tambi\u00e9n se dividen con m\u00e1s frecuencia que las c\u00e9lulas normales.\u00a0Estos descubrimientos condujeron a poderosos tratamientos, que incluyen quimioterapia e inmunoterapias.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">Pero estas ideas son relativamente toscas, como pintar el paisaje gen\u00f3mico del c\u00e1ncer con una amplia pincelada;\u00a0poca individualidad se filtra. Y con el c\u00e1ncer, la singularidad tanto del hu\u00e9sped como del patr\u00f3n de mutaciones gen\u00e9ticas son importantes.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">Introduzca las firmas mutacionales.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">Aqu\u00ed, la atenci\u00f3n se centra en los cambios en las letras precisas del ADN a medida que una c\u00e9lula se vuelve cancerosa.\u00a0Los diferentes tipos de c\u00e1ncer tienen mutaciones distintas mientras comparten ciertos puntos en com\u00fan.\u00a0Estas firmas capturan tanto los h\u00e1bitos del hu\u00e9sped, por ejemplo, si fuma, como el c\u00e1ncer en s\u00ed mismo, como la incapacidad de reparar el ADN da\u00f1ado.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">En otras palabras, una firma mutacional captura un patr\u00f3n espec\u00edfico de cambios y reparaciones en las letras del ADN en una huella dactilar altamente personalizada del c\u00e1ncer de una persona.\u00a0Al igual que con las huellas dactilares reales, existen similitudes entre diferentes personas y tipos de c\u00e1ncer.\u00a0El estudio tom\u00f3 una ruta inteligente: primero, buscaron firmas comunes en c\u00e1nceres de diferentes \u00f3rganos y personas.\u00a0Luego, examinaron las firmas entre los \u00f3rganos, y finalmente identificaron 120 firmas mutacionales clave comunes en todos los c\u00e1nceres del estudio.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">El proceso es como tomar fotos de diferentes rostros, pero eventualmente mezcl\u00e1ndolos para encontrar rasgos comunes en las caracter\u00edsticas, al mismo tiempo que se resaltan las diferencias.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">El equipo tuvo suerte con un activo enorme: el\u00a0<a style=\"color: #000000;\" href=\"https:\/\/www.genomicsengland.co.uk\/initiatives\/100000-genomes-project\">Proyecto 100,000 Genomas<\/a>\u00a0de Genomics England, que secuenci\u00f3 el genoma completo de decenas de miles de personas.\u00a0\u201cTiene una mayor cantidad de secuencias de genoma completo que los principales proyectos anteriores de secuenciaci\u00f3n del c\u00e1ncer juntos\u201d, dijo el Dr. D\u00e1vid Sz\u00fcts del Centro de Investigaci\u00f3n de Ciencias Naturales de Budapest, que no particip\u00f3 en el estudio.\u00a0&#8220;Debido a que a\u00fan se desconoce el mecanismo detr\u00e1s de muchas firmas, el estudio&#8230; tambi\u00e9n proporciona un terreno f\u00e9rtil para una mayor investigaci\u00f3n&#8221;.<\/span><\/p>\n<h3 style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">Un arcoiris de mutaciones<\/span><\/h3>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">En total, el equipo evalu\u00f3 cambios de letras de ADN simples o dobles en 12,222 muestras de c\u00e1ncer.\u00a0El conjunto de datos resultante fue una bestia para matar.\u00a0Para detectar firmas mutacionales, desarrollaron un m\u00e9todo computacional que analiza las mutaciones comunes de las m\u00e1s raras.\u00a0Como prueba de cordura, el equipo valid\u00f3 sus hallazgos comparando los datos de dos bases de datos de c\u00f3digo abierto, cada una de las cuales conten\u00eda aproximadamente 3000 muestras de c\u00e1ncer.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">[Observamos] &#8220;miles y miles de mutaciones, y eso nos da mucho poder para poder observar patrones en muestras de pacientes&#8221;, dijo Nik-Zainal.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">Para cada \u00f3rgano, el equipo encontr\u00f3 solo de 5 a 10 firmas comunes, lo que sugiere un hilo com\u00fan en los c\u00e1nceres que podr\u00eda ser cooptado para un mejor tratamiento.\u00a0Al hacer coincidir las firmas en todos los \u00f3rganos, encontraron 58 nuevas huellas dactilares, que se compararon con un intento global anterior para\u00a0<a style=\"color: #000000;\" href=\"https:\/\/www.nature.com\/collections\/afdejfafdb\/\">documentar las mutaciones del c\u00e1ncer<\/a>\u00a0.\u00a0Algunos eran comunes entre los pacientes;\u00a0otros m\u00e1s singulares, sacando a relucir el car\u00e1cter de &#8220;copo de nieve&#8221; de los c\u00e1nceres.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">Con m\u00e1s trabajo de detective, buscaron las posibles causas de las firmas de mutaci\u00f3n.\u00a0Algunos de los culpables ya eran bien conocidos: los nip-tucks que comprometen la capacidad del ADN para repararse a s\u00ed mismo despu\u00e9s de una ruptura.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">Otros revelaron da\u00f1os m\u00e1s enigm\u00e1ticos.\u00a0Una firma para los tumores cerebrales, por ejemplo, fue sorprendentemente similar a las muestras expuestas a la luz ultravioleta.\u00a0La exposici\u00f3n al platino coincidi\u00f3 con m\u00faltiples tipos de c\u00e1ncer, incluidos el c\u00e1ncer de ovario, est\u00f3mago y mama.\u00a0Otra firma, denominada SBS4 (s\u00ed, no tienen los nombres m\u00e1s llamativos) est\u00e1 muy asociada con el consumo de tabaco, pero con una coincidencia sorprendente con el c\u00e1ncer de mama y colon, potencialmente, un objetivo para el desarrollo de f\u00e1rmacos para matar varios p\u00e1jaros de un tiro.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">Al igual que los colores, las firmas mutacionales se pueden combinar en un espectro, un arco\u00edris de diferentes perfiles de mutaci\u00f3n.\u00a0Si eso suena complejo, es porque el c\u00e1ncer es extremadamente complejo.\u00a0Diferentes firmas pueden ayudarnos a deconstruir una receta gen\u00e9tica compleja y cancerosa para que podamos entenderla y, a su vez, saber c\u00f3mo controlarla.<\/span><\/p>\n<h3 style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">\u00bfQu\u00e9 sigue?<\/span><\/h3>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">La toma de huellas dactilares de los genomas del c\u00e1ncer no es exactamente llamativa, pero la base de datos podr\u00eda impulsar la pr\u00f3xima generaci\u00f3n de tratamientos contra el c\u00e1ncer.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">La cantidad de informaci\u00f3n es asombrosa, incluso los autores admitieron que se dieron por vencidos ante m\u00e1s an\u00e1lisis.\u00a0En cambio, desarrollaron y lanzaron un algoritmo que ajusta los nuevos datos gen\u00e9ticos del c\u00e1ncer al conjunto de datos.\u00a0Apodado FitMS, o Signature Fit Multi-Step, el software adopta el mismo enfoque que el estudio: primero ajusta las firmas a las comunes y luego ampl\u00eda el alcance para identificar firmas raras adicionales.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">La herramienta est\u00e1 disponible gratuitamente para que los m\u00e9dicos puedan comparar una nueva muestra de tejido con la base de datos.\u00a0Este proceso de &#8220;ajuste de firmas&#8221; puede, en teor\u00eda, diagnosticar y adaptar el tratamiento del c\u00e1ncer del paciente a su conjunto particular de mutaciones.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #000000;\">\u201cEste estudio muestra cu\u00e1n poderosas pueden ser las pruebas de secuenciaci\u00f3n del genoma completo para dar pistas sobre c\u00f3mo se puede haber desarrollado el c\u00e1ncer, c\u00f3mo se comportar\u00e1 y qu\u00e9 opciones de tratamiento funcionar\u00edan mejor\u201d,\u00a0<a style=\"color: #000000;\" href=\"https:\/\/www.sciencedaily.com\/releases\/2022\/04\/220421141552.htm\">dijo<\/a>\u00a0Michelle Mitchell de Cancer Research UK.<\/span><\/p>\n<p>Fuente:<\/p>\n<p>Fan, S. (2022d, abril 25). <i>Largest Genetic Study to Date Unveils DNA Profiles That Lead to Cancer<\/i>. Singularity Hub. Recuperado 26 de abril de 2022, de https:\/\/singularityhub.com\/2022\/04\/26\/largest-genetic-study-to-date-unveils-dna-profiles-that-lead-to-cancer\/<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Los c\u00e1nceres son como copos de nieve maliciosos.\u00a0Cada uno alberga un conjunto \u00fanico de mutaciones en sus genes, volvi\u00e9ndolos gradualmente hacia el lado oscuro.\u00a0Eventualmente, sin tener en cuenta a sus vecinos, las c\u00e9lulas mutadas destruyen tejidos, \u00f3rganos y vida.<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":26985,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[56],"tags":[],"class_list":["post-26984","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-ciencia"],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO plugin v26.7 - https:\/\/yoast.com\/wordpress\/plugins\/seo\/ -->\n<title>El estudio 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